La Fundación CEAM y la Universidad de Alicante (UA) iniciaron la colaboración el año 1991, con el desarrollo del “Programa de Investigación para La restauración de la cubierta vegetal en la Comunidad Valenciana”, promovido inicialmente por el Conseller y Catedrático de la Universidad de Alicante Antonio Escarré. Desde entonces, la colaboración entre CEAM y la UA se establece principalmente con el Departamento de Ecología en líneas de investigación afines y complementarias en el campo de la Ecología Terrestres y la Restauración Ecológica.
Esta colaboración busca sinergias entre ambas instituciones con la participación de investigadores del CEAM y profesores de la UA en proyectos conjuntos. Estos proyectos se han financiado, por ejemplo, en el ámbito de los Programas Marco de I+D de la Comisión Europea, del Plan Nacional de I+D, del programa de I+D+i de la Generalitat Valenciana, así como otros proyectos de I+D en otras convocatorias públicas, privadas o bajo prestaciones de servicio. Desde el 31 de marzo de 2011, la colaboración ha quedado regulada en el marco de los convenios de colaboración de la UNIDAD MIXTA UA-CEAM. Estos convenios se renuevan cada 5 años, estando vigente la última actualización hasta 2027.
En la actualidad, la unidad mixta está formada por un total de 19 investigadores. Por parte del CEAM, se dispone de 4 investigadores doctores con contratos indefinidos en la Fundación, un investigador postdoctoral, un investigador predoctoral y 4 técnicos de apoyo a la investigación. Por parte de la UA, se dispone de 3 catedráticos universitarios, 5 profesores titulares y un técnico de apoyo a la investigación (ver anexo del convenio actual para más detalles).
En el marco de esta unidad mixta, se comparten las infraestructuras científicas de cada entidad (instrumental, instalaciones de laboratorio y parcelas permanentes experimentales de campo) para optimizar la ejecución de los proyectos. Para mejorar esta interacción, una parte de los investigadores del programa de Investigación Forestal del CEAM tienen su lugar de trabajo en dependencias de la Universidad de Alicante. Desde 1992, los miembros del CEAM ocuparon el antiguo barracón de la Escuela de Enfermería y posteriormente se trasladaron al antiguo dispensario médico. Actualmente, y desde 2000, los investigadores del CEAM disponen de 3 despachos en la planta baja de la Fase V de la Facultad de Ciencias.
La colaboración CEAM-UA también abarca los campos de la docencia y formación de profesionales. En el marco de la Unidad Mixta UA-CEAM, se han dirigido numerosas tesis doctorales, trabajos de fin de máster y de grado. Cada año, alumnos de la Universidad de Alicante realizan prácticas profesionales en las dependencias del CEAM, muchos de los cuales han proseguido en contratos laborales en el marco de los proyectos de investigación. Por otro lado, la experiencia del personal del CEAM en investigación también se ve transmitida al alumnado de la Universidad de Alicante mediante colaboraciones docentes.