Programa de Contaminació Atmosfèrica:

1. Àrea Química Atmosfèrica: Investigació en els processos de transformació química dels components de l'atmosfera utilitzant els reactors fotoquímics EUPHORE per a simular condicions reals.

2. Àrea Dinàmica de Contaminants (I+D): Caracterització dels processos meteorològics responsables del transport i difusió de contaminants atmosfèrics a escala regional, que donen lloc a patrons de contaminació i situacions episòdiques característiques en la vessant mediterrània.
3. Àrea Dinàmica de Contaminants (Aplicació)
4. Grup Emergent: Desenvolupament Tecnològic: Optimització, modificació o generació d'instrumentació que cobrisca les necessitats dels investigadors.

Programa de Efectes dels Contaminants:
   Investigació dels efectes que sobre diferents comunitats vegetals (naturals i agrícoles) exercix la presència de certs nivells de contaminants en l'aire i, en especial, els registrats habitualment en la vessant llevantina, orientada al disseny d'estratègies de minimització a diferents nivells.

Programa d'Investigació Forestal:

   Investigació i desenvolupament de noves tècniques de gestió forestal en condicions mediterrànies i, especialment, de restauració de muntanyes afectades per incendis i processos de desertificació

Programa de Meteorologia i Climatologia:

    Anàlisi dels mecanismes i condicions meteorològiques (a escala sinòptica i regional ) que donen lloc a situacions de risc meteorològic en la vessant llevantina, en relació, principalment, amb les precipitacions torrencials i els incendis forestals.